ИЦАЭ Калининграда принял участие в биоинформатическом хакатоне
13 мая Информационный центр по атомной энергии (ИЦАЭ) Калининграда принял участие в защите проектов на Living System Hack (LShack-хакатоне) для студентов по решению задач по химии, биологии и биоинформатике, организованном Центром геномных исследований Института живых систем БФУ им. И. Канта.
С 6 по 12 мая в режиме онлайн учащиеся программ бакалавриата, специалитета и магистратуры соответствующих тематике хакатона специальностей Института живых систем БФУ им. И. Канта пробовали найти программные и системные решения к различным конкурсным задачам.
Так, двадцати одной команде-участнице предстояло разрешить ту или иную научно-практическую задачу, использовав собственные знания на стыке биологии и информатики: от таких серьёзных, как определение видов бактерий в метагеноме, прогнозирования вероятности сердечной недостаточности у человека и предсказания свойств определённого белка до шуточных кейсов с узнаванием видов динозавров в человеке и определения победителя в битве покемонов способами биоинформатики.
К примеру, одна из команд достойно представила защиту своего решения по конкурсному кейсу от сети ИЦАЭ: согласно заданию, необходимо было построить график распределения зарегистрированных сигналов по амплитуде и заряду отклика, а также определить среднее значение заряда отклика сцинтилляторного детектора (прибора, регистрирующего вещества, излучающие гамма- и другие спектры) и качество его светосбора.
Участники проанализировали спектр сцинтилляционного детектора заряженных частиц: в ходе проведённой работы выяснилось, что при запуске определённого кодового алгоритма по исходной базе данных на выходе человек зрительно может определить вероятную амплитуду отклика детектора на один мюон: при полученном математическом распределении он равен 50 мВ.
Также исследователи задачи обнаружили, что число электронов на выходе на один первичный фотоэлектрон составило 10 в шестой степени, а ещё им удалось определить число фотоэлектронов, фотонов, попавших на фотокатод, и непосредственно сам коэффицент светосбора. Работа команды была отдельно отмечена членами жюри.
Победу в биоинформатическом хакатоне жюри присудило команде, решившей научно-практический кейс под названием «Битва покемонов»: под шуточным названием скрывается качественная работа с целью «научить машину» составить алгоритмический «калькулятор» «битвы покемонов», принимая во внимание их видовое разнообразие («стихии» и «виды атаки»). База данных анализа биоинформатиков составила около 800 объектов.
Интересен и тот факт, что выбор жюри полностью совпал с зрительскими симпатиями в зале – настолько эффектно и качественно команда представила свой проект, результатом которого является действительно работающее алгоритмическое решение кейса.
Вторыми стали студенты-биоинформатики, исследовавшие различия между разыми видами птиц и их видовыми свойствами.
Почётное третье место заняла команда исследователей, взявших в работу очень «жизненный» кейс – ребята пытались методами биоинформатики определить, существует ли любовь с первого взгляда. Научный подход привёл студентов к следующим выводам: женщин стабильно привлекают образованные и искренние мужчины, а вот мужчины в женщинах оценивают прежде всего скромность. По итогу работы студенты пришли к мнению, что ценность субъекта на «рынке свиданий» составляет 3-4 человека, готовых встретиться повторно.
Команды-победительницы получили памятные призы от жюри и сети ИЦАЭ, а также потенциальную возможность превратить свои наработки в самостоятельные научно-технологические проекты.
ИЦАЭ Калининграда активно участвует в онлайн- и офлайн-мероприятиях IT- и научно-практической направленности среди молодёжи города и области.